无限可能—微生物细胞工厂开创定制化新时代

时间:2024-11-18 10:21:00 来源:网络   阅读量:9622   会员投稿

微生物细胞工厂构建作为一种颠覆性的技术,正在崭露头角,成为生命科学研究领域的焦点之一。通过对微生物基因组、代谢通路和生物功能进行精准的调控和优化,微生物细胞工厂不仅为我们提供了生物学上的新视角,也为解决人类面临的各种挑战带来了新的解决方案。


微生物细胞工厂示意图

01 微生物细胞工厂的基础概念

微生物细胞工厂是指经过基因组工程或代谢工程改造的微生物菌株,通常是细菌或酵母等单细胞生物。它们在实验室中经过人工精确设计和改造,使其具备特定的功能或产生特定的产物。科学家们通过定制化设计微生物,使其成为高效的生产工具,应用于药物生产、化学品合成、能源生产、环境修复等领域。


微生物细胞工厂示意图

02 微生物细胞工厂构建全流程

构建微生物细胞工厂不仅可以提高生产效率,还可以降低生产成本,为工业生产带来革命性的变革。以下是微生物细胞工厂构建的全流程:

1. 路线设计:根据期望获得的功能或产物设计生产路线。

2. 底盘细胞选择 :确定需要改造的微生物,选择一个性状优良的底盘细胞,也就是用于改造的宿主细胞。

3. 代谢途径重建:通过设计、构建、验证策略来设计代谢途径。新兴基因编辑、合成工具加速生产宿主中代谢途径的构建。

4. 耐受性增强:对初次得到的菌种进行持续的筛选、优化,通过理性或适应性实验室进化 (Adaptive laboratory evolution ,ALE)来增强菌种的耐受性。

5. 代谢通量优化:运用DNA测序、基因合成与组装及基因编辑等技术加速代谢通量和代谢载量的优化,使目标产品的生产效率最大化。

6. 发酵:发酵过程与菌种开发同步进行 提供数据反馈 。

7. 产品回收和纯化:根据产品特点选择合适的纯化路径,并且优化纯化条件。

8. 放大:根据回收和纯化的数据对代谢通量进行反复优化,以实现从实验室规模到商业化生产的放大。


Systems Metabolic Engineering Strategies: Integrating Systems and Synthetic Biology with Metabolic Engineering

03 微生物细胞工厂构建的技术方法

微生物细胞工厂构建过程中涉及多种常用的技术方法,主要包括基因合成、基因编辑、代谢工程和蛋白工程等技术:

基因合成

基因合成技术可用于构建合成新的代谢通路、调控元件或功能模块,为微生物的功能增强和新功能引入提供基础。

基因编辑

利用CRISPR-Cas9、TALENs、ZFNs等基因组编辑工具,对微生物的基因组进行精准编辑,实现目标基因的敲入、敲除或修饰。可用于改变目标菌株的性状、代谢途径或生物学功能。

代谢工程

通过调控菌株的代谢途径或代谢通路,可提高目标产物的产量、改变代谢产物的结构或选择性合成特定代谢产物,从而实现对微生物的功能优化和产物生产的调控。

蛋白工程

通过改变目标蛋白的结构或功能,以提高其活性、稳定性或特异性,从而增强目标产物的合成能力。这涉及到蛋白质设计、蛋白结构预测、蛋白进化等技术。

高通量筛选

利用高通量的筛选方法,如微流控技术、高通量测序等,快速筛选和鉴定具有目标性状的菌株。

系统生物学分析

利用系统生物学的方法,对微生物的代谢网络和调控网络进行建模和分析,揭示微生物工程改造的规律和原理。


构建微生物细胞工厂相关技术

这些技术方法相互结合,构成了微生物细胞工厂构建的核心技术体系,为微生物工程应用领域的发展提供了重要的技术支持。同时,随着生物技术的不断发展和创新,还会涌现出更多新技术和方法,为微生物细胞工厂提供更多的可能。

04 微生物细胞工厂的应用领域

微生物细胞工厂在各个领域都有广泛的实际应用,以下列举了几个典型的应用领域:

药物生产:微生物细胞工厂可被用来生产各种药物,如抗生素、生物素等,实现对目标药物的高效合成,降低生产成本并提高产量和纯度。

生物燃料生产:微生物细胞工厂可以将廉价的生物质原料转化为高效的生物燃料,如生物柴油、生物乙醇等,有望解决传统燃料资源的短缺和环境污染问题。

化学品合成:微生物细胞工厂可以实现对目标化学品的高效生产,如有机酸、氨基酸、醇类等,具有潜在的工业应用前景。

食品工业:微生物细胞工厂可以合成具有特定功能和营养价值的食品成分,如有机酸、醇类等,为食品工业的创新和发展提供了新的途径。

环境修复:微生物细胞工厂可以被用来处理污水、降解有机废物等,有望解决环境污染和资源浪费等问题。

微生物细胞工厂在药物生产、生物燃料生产、化学品合成、食品工业和环境修复等各个应用领域都有实际应用,为解决人类面临的各种挑战提供了新的解决方案,具有广阔的应用前景和社会经济效益。

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泓迅生物—案例分享

研究背景:结肠炎是一种常见且具有挑战性的胃肠道疾病。利用基因工程改变代谢途径,使大肠杆菌能够可持续地合成3-羟基丁酸(3-HB),成为治疗结肠炎的有效策略。

研究目的:野生型大肠杆菌益生菌Nissle1917缺乏自主合成3-HB的能力,因此需要在其代谢途径中进行精确的基因工程,以建立3-HB合成的新途径。

结果展示:在大肠杆菌中成功构建了3-羟基丁酸的合成途径,并获得了高表达的敲除菌株。

最终成功交付了满足客户要求的完美菌株。


References

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